明徳元年越前国賀郡気比神宮より、八幡大神の御分霊を同国笠原右源太が当地に奉還。その後河野加賀守森幸が、右源太の孫左衛門をして本殿造営をしたが、松前藩祖信弘との戦乱の為、祭祀営繕不能となる。

蝦夷地大乱の時、松前藩４代目慶広が南部大澗より渡来の智楽院（藤山家の祖先）に七飯村藤山頂上で必勝祈願をさせ大勝し、その時アイヌ勢が七重浜の柏樹草木を軍勢と見て降参したのは八幡宮の加護と、藩祖信弘の大弓半弓矢を奉納、正月６日の法楽神事を仰付け、七重浜の柏樹林の伐採を禁じ、松前藩の祈願所に定めた。

慶長８年１０月本殿拝殿を建立（現神輿殿・文久２年８月改築）。毎年祭祀料玄米２５俵、各村の役納を仰付け大祭前に代参。明治元年蝦夷統督清水谷侍従参拝。戊辰戦争では、榎本武揚・大鳥圭介等が当宮神殿で降伏を誓約。同２年８，１２月侍従東久世通参拝。同年９年郷社。同１５年来栖川宮一品　仁親王御真筆の奉納。同４１年神幣料共進神社に指定。